More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5531 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 963 aa  1863    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  41.55 
 
 		 1003 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.15 
 
 		 990 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 1017 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  47.52 
 
 		 1138 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 981 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 992 aa  363  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 1022 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.67 
 
 		 934 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 996 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 1024 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  34.33 
 
 		 954 aa  338  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 990 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.77 
 
 		 1025 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  40.46 
 
 		 1025 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  39.38 
 
 		 935 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.48 
 
 		 992 aa  328  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 1071 aa  327  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39.59 
 
 		 1088 aa  327  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.75 
 
 		 1021 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  40.87 
 
 		 775 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.21 
 
 		 931 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  39.45 
 
 		 1030 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  39.11 
 
 		 941 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 950 aa  316  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 1022 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 971 aa  314  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.49 
 
 		 1003 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 995 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.98 
 
 		 1010 aa  305  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.27 
 
 		 1013 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 962 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 946 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 964 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 1014 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.15 
 
 		 919 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 654 aa  294  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  37.42 
 
 		 913 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.14 
 
 		 921 aa  290  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 930 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1027 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 940 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 621 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 921 aa  281  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 993 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 1034 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 1108 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.12 
 
 		 1020 aa  277  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 1008 aa  275  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  37.92 
 
 		 910 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.68 
 
 		 907 aa  270  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 965 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 970 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  33.05 
 
 		 1033 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  38.41 
 
 		 632 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.06 
 
 		 967 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 1319 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.61 
 
 		 496 aa  263  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 928 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 1346 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 965 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 1011 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 		 956 aa  257  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 612 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.45 
 
 		 926 aa  253  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 910 aa  254  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.12 
 
 		 908 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.56 
 
 		 993 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 1048 aa  244  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 850 aa  243  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 928 aa  243  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  39.04 
 
 		 1001 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 983 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 989 aa  237  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 982 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.25 
 
 		 1003 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.57 
 
 		 915 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 994 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.37 
 
 		 1030 aa  230  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 666 aa  230  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.1 
 
 		 631 aa  227  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 622 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  35.62 
 
 		 937 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29 
 
 		 981 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 1054 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 453 aa  221  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  38.5 
 
 		 978 aa  220  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 582 aa  214  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.28 
 
 		 788 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.45 
 
 		 790 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 806 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 1033 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 621 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  31.6 
 
 		 792 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.2 
 
 		 797 aa  204  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  32.95 
 
 		 715 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.87 
 
 		 814 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 		 810 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.06 
 
 		 915 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.03 
 
 		 783 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>