More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9294 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1003 aa  1944    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  43.89 
 
 		 990 aa  628  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  41.45 
 
 		 963 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  38.29 
 
 		 992 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  40.11 
 
 		 1138 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  45.63 
 
 		 1024 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 1022 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 1108 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.39 
 
 		 981 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.77 
 
 		 992 aa  399  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.71 
 
 		 996 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 993 aa  396  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  36.34 
 
 		 954 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 965 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 1025 aa  376  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 971 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 964 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.61 
 
 		 1021 aa  364  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 941 aa  364  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 654 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 934 aa  357  7.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1027 aa  354  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.35 
 
 		 1088 aa  354  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.29 
 
 		 1010 aa  351  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 1020 aa  351  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 1071 aa  350  8e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.38 
 
 		 1022 aa  350  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  41.53 
 
 		 1030 aa  347  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  39.97 
 
 		 775 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 		 1017 aa  343  9e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  39.8 
 
 		 1025 aa  341  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 946 aa  340  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 1013 aa  337  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 		 621 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 950 aa  330  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 919 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  37.89 
 
 		 1008 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.7 
 
 		 940 aa  329  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 1048 aa  327  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 1319 aa  324  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.23 
 
 		 956 aa  324  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.89 
 
 		 965 aa  322  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.09 
 
 		 1014 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 970 aa  320  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 921 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 931 aa  314  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.15 
 
 		 921 aa  313  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 1346 aa  313  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 928 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 962 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.83 
 
 		 1003 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 981 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.64 
 
 		 1011 aa  307  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 		 913 aa  307  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 1034 aa  304  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 907 aa  303  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 990 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 995 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.5 
 
 		 930 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.03 
 
 		 908 aa  297  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 666 aa  297  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  39.61 
 
 		 632 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 1033 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.35 
 
 		 935 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 928 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.74 
 
 		 1054 aa  289  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 		 993 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 612 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 850 aa  275  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 1001 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 989 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 910 aa  266  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 967 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 		 983 aa  262  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 1030 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.17 
 
 		 496 aa  260  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  37.9 
 
 		 788 aa  257  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.48 
 
 		 790 aa  249  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 910 aa  248  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.67 
 
 		 453 aa  248  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.56 
 
 		 792 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.16 
 
 		 994 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 814 aa  242  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 582 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  32.97 
 
 		 715 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.88 
 
 		 982 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  33.13 
 
 		 783 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.92 
 
 		 926 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  36.87 
 
 		 978 aa  237  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.21 
 
 		 631 aa  233  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.91 
 
 		 797 aa  231  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 1003 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 806 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 915 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 621 aa  222  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.74 
 
 		 915 aa  221  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.05 
 
 		 937 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 810 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>