More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0576 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 946 aa  1881    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  39.38 
 
 		 965 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.48 
 
 		 993 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 919 aa  505  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 941 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  36.87 
 
 		 970 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 967 aa  489  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 928 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 956 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 908 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 907 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 940 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 921 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.22 
 
 		 930 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 928 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 981 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 1025 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 996 aa  376  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 937 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.09 
 
 		 992 aa  363  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1071 aa  360  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 1020 aa  360  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 931 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 1088 aa  358  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 1030 aa  357  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  38.77 
 
 		 814 aa  355  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  38.45 
 
 		 838 aa  354  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.76 
 
 		 742 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.89 
 
 		 806 aa  337  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.9 
 
 		 921 aa  337  9e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.58 
 
 		 1022 aa  334  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 964 aa  333  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 1011 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1014 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 1021 aa  328  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.21 
 
 		 1004 aa  328  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 962 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.89 
 
 		 1003 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 971 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  37.21 
 
 		 1003 aa  324  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 1027 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.87 
 
 		 1022 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.37 
 
 		 1010 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 950 aa  322  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 995 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.03 
 
 		 990 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 		 1108 aa  316  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.63 
 
 		 934 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 1048 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.86 
 
 		 1017 aa  311  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 965 aa  308  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 990 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  35.34 
 
 		 797 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 992 aa  297  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 1034 aa  296  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.02 
 
 		 983 aa  294  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.53 
 
 		 1054 aa  294  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 954 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1033 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 935 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  39.12 
 
 		 1001 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1013 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 775 aa  286  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.72 
 
 		 913 aa  284  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 915 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 850 aa  280  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 621 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 654 aa  277  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.28 
 
 		 790 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 1030 aa  270  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 963 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 993 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.06 
 
 		 788 aa  265  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.04 
 
 		 981 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.78 
 
 		 757 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 1003 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 989 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 755 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 1008 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 982 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  35.65 
 
 		 687 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.92 
 
 		 1024 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.7 
 
 		 496 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 1138 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.49 
 
 		 783 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 770 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 582 aa  233  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.29 
 
 		 792 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  27.76 
 
 		 1033 aa  231  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 621 aa  229  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 910 aa  229  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.64 
 
 		 715 aa  229  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 632 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 1319 aa  225  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  31.27 
 
 		 775 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 994 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.6 
 
 		 978 aa  216  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 1346 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 1060 aa  214  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 453 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>