More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2936 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1054 aa  2004    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 1025 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.56 
 
 		 1088 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 915 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 1030 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 1071 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 1020 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 931 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 965 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 965 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.08 
 
 		 989 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.51 
 
 		 921 aa  359  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.05 
 
 		 921 aa  355  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  37.65 
 
 		 788 aa  349  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 919 aa  347  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 995 aa  342  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1014 aa  335  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.19 
 
 		 946 aa  329  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 940 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.71 
 
 		 1027 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31 
 
 		 1022 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 		 1003 aa  324  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 1033 aa  324  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 		 981 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 990 aa  323  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  36.45 
 
 		 790 aa  322  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1010 aa  321  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.58 
 
 		 992 aa  321  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 930 aa  320  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 956 aa  320  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.6 
 
 		 964 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 1048 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 1017 aa  314  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 1030 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 907 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 908 aa  310  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 967 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 990 aa  309  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 850 aa  303  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 996 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.79 
 
 		 775 aa  300  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 913 aa  299  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  37.79 
 
 		 715 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 1008 aa  298  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 934 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 928 aa  294  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 1003 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.16 
 
 		 970 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 1025 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 971 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 1013 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 993 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 962 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 937 aa  282  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.43 
 
 		 982 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 993 aa  272  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 941 aa  270  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 1108 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.74 
 
 		 1022 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  33.5 
 
 		 797 aa  267  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 950 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  31.9 
 
 		 1021 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 1001 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 		 992 aa  263  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 983 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 1034 aa  254  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 981 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  36.79 
 
 		 838 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 1003 aa  252  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  37.07 
 
 		 775 aa  251  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 		 741 aa  250  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 978 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 954 aa  248  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 928 aa  247  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.88 
 
 		 792 aa  243  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  32.76 
 
 		 783 aa  241  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.79 
 
 		 742 aa  237  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 		 963 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.05 
 
 		 496 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 806 aa  231  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 1024 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 1319 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 621 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 814 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 935 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 654 aa  224  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 1346 aa  217  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  35.67 
 
 		 782 aa  217  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 1004 aa  216  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 1011 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1138 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.01 
 
 		 582 aa  212  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 680 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  30.87 
 
 		 757 aa  208  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.82 
 
 		 994 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 612 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  35.03 
 
 		 690 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.79 
 
 		 632 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 770 aa  197  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>