207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4182 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  100 
 
 		 690 aa  1327    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  38.73 
 
 		 790 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.56 
 
 		 788 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 850 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 755 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 919 aa  227  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.31 
 
 		 797 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  35.13 
 
 		 715 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1088 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.68 
 
 		 792 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 915 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 908 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 965 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  40.42 
 
 		 838 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 1020 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1004 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.72 
 
 		 921 aa  191  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 993 aa  190  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 967 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 930 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.86 
 
 		 956 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 970 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.09 
 
 		 940 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 941 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 1025 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 1071 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1022 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 913 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 1030 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 946 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 1048 aa  180  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.23 
 
 		 992 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.58 
 
 		 1011 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 928 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 1027 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 993 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.78 
 
 		 1014 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32.23 
 
 		 1033 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  29.03 
 
 		 921 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.77 
 
 		 742 aa  170  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 		 931 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 928 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 934 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  31 
 
 		 715 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 806 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  30.56 
 
 		 1001 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.49 
 
 		 1108 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  29.12 
 
 		 964 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 935 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.39 
 
 		 982 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 775 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 		 962 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.95 
 
 		 775 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 965 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 990 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 		 770 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 995 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 1054 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 1003 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 		 983 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.31 
 
 		 996 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 1022 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 814 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.6 
 
 		 741 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  28.65 
 
 		 1010 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 		 978 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  33.75 
 
 		 708 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 782 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.38 
 
 		 1008 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  39.08 
 
 		 926 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 761 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 937 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 981 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 990 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 950 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.16 
 
 		 1030 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  28.64 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  41.91 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  31.55 
 
 		 910 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.72 
 
 		 971 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 1021 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  30.57 
 
 		 834 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  30.78 
 
 		 910 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 		 792 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.32 
 
 		 1138 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 1013 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.52 
 
 		 1024 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  27.78 
 
 		 1003 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 954 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 907 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  30.93 
 
 		 1003 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 907 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  31.98 
 
 		 680 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  30.46 
 
 		 827 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  31.01 
 
 		 978 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.87 
 
 		 989 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  29.85 
 
 		 941 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  36.9 
 
 		 862 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  27.86 
 
 		 1017 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>