More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1985 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 797 aa  1584    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  44.67 
 
 		 790 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  42.26 
 
 		 788 aa  512  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  41.59 
 
 		 755 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 931 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.34 
 
 		 946 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 919 aa  310  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  36.35 
 
 		 970 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 915 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 1071 aa  302  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.3 
 
 		 993 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 1048 aa  290  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 965 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 		 1020 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 806 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 850 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 1030 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.64 
 
 		 1088 aa  274  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  40.59 
 
 		 715 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 981 aa  270  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 1022 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.96 
 
 		 1108 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.28 
 
 		 1025 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.35 
 
 		 921 aa  264  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.68 
 
 		 792 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  39.83 
 
 		 838 aa  258  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 941 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 956 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 967 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.77 
 
 		 908 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 		 1027 aa  250  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 928 aa  250  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 930 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 1033 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 913 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 996 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 814 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  41.71 
 
 		 1014 aa  237  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  30.2 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.78 
 
 		 992 aa  234  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  39.35 
 
 		 995 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 907 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  34.36 
 
 		 775 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.71 
 
 		 965 aa  230  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 1011 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  34.46 
 
 		 690 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 950 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  40.28 
 
 		 990 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.57 
 
 		 1054 aa  227  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 1004 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.3 
 
 		 954 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 928 aa  220  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  30.42 
 
 		 715 aa  220  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.14 
 
 		 783 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 		 742 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 		 1138 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  29.85 
 
 		 992 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.19 
 
 		 940 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.89 
 
 		 934 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 971 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  36.3 
 
 		 1034 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 921 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 		 1003 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.06 
 
 		 1010 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 775 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 978 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.18 
 
 		 1008 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.17 
 
 		 990 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 1003 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  44.2 
 
 		 1001 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 993 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  39.05 
 
 		 989 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 782 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.51 
 
 		 1003 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  36.06 
 
 		 962 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 1017 aa  200  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.5 
 
 		 1022 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 1025 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  31.09 
 
 		 1021 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 1024 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 		 983 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 937 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.48 
 
 		 964 aa  190  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 935 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 757 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 982 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 462 aa  184  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  30.01 
 
 		 907 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  27.91 
 
 		 834 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 1319 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  30.85 
 
 		 708 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  29.45 
 
 		 941 aa  178  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 680 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 1346 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.64 
 
 		 963 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 632 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  37.94 
 
 		 612 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 896 aa  168  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 1013 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  41.52 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>