More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2843 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 907 aa  1808    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  30.78 
 
 		 788 aa  234  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.41 
 
 		 941 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 1020 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  28.33 
 
 		 941 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 962 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 850 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  30.95 
 
 		 790 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  30.18 
 
 		 792 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 1088 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 946 aa  199  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.26 
 
 		 797 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 919 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  29.1 
 
 		 783 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.22 
 
 		 993 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.37 
 
 		 981 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 1048 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  29.24 
 
 		 970 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  27.54 
 
 		 1017 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.04 
 
 		 996 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.04 
 
 		 1027 aa  185  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  32.05 
 
 		 862 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 971 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 		 1025 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.37 
 
 		 990 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.83 
 
 		 913 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1013 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.13 
 
 		 934 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.14 
 
 		 956 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.4 
 
 		 965 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  30.71 
 
 		 814 aa  171  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 915 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  29.22 
 
 		 715 aa  168  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 928 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 990 aa  168  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 1003 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.21 
 
 		 1003 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.41 
 
 		 921 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  35.5 
 
 		 838 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  29.42 
 
 		 931 aa  162  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  29.99 
 
 		 908 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 989 aa  161  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  29.83 
 
 		 928 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  30.58 
 
 		 708 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  28 
 
 		 1008 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1030 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 1108 aa  158  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.67 
 
 		 1021 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  28.47 
 
 		 982 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  25.83 
 
 		 1022 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  28.4 
 
 		 827 aa  155  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 		 921 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 806 aa  154  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.56 
 
 		 1022 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  26.7 
 
 		 907 aa  154  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.05 
 
 		 1054 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 742 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.55 
 
 		 1010 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 1071 aa  152  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  26.92 
 
 		 834 aa  152  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1011 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 755 aa  151  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.82 
 
 		 1004 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 993 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  25.99 
 
 		 1034 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 1030 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  33.69 
 
 		 1014 aa  147  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 1138 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 		 964 aa  144  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.1 
 
 		 757 aa  142  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.71 
 
 		 992 aa  141  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 792 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  28.55 
 
 		 935 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 775 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.82 
 
 		 967 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  28.62 
 
 		 775 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 1003 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  30.38 
 
 		 690 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  26.44 
 
 		 741 aa  137  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  29.52 
 
 		 940 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  27.1 
 
 		 715 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 963 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 1024 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.22 
 
 		 937 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 930 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 		 1025 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 954 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 		 1001 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  33.69 
 
 		 782 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  27.15 
 
 		 1060 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 992 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 983 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  26.27 
 
 		 832 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  28.62 
 
 		 950 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 632 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  28 
 
 		 910 aa  123  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  30.66 
 
 		 965 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 770 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 1319 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 612 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>