More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5351 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  100 
 
 		 862 aa  1702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 782 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  36.95 
 
 		 964 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  37.32 
 
 		 992 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 996 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 981 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 941 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 1008 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 913 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.83 
 
 		 931 aa  271  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  34.33 
 
 		 832 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 1022 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 1020 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.06 
 
 		 1017 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 919 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.7 
 
 		 788 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 1034 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1025 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 962 aa  237  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 1003 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.77 
 
 		 792 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  31.97 
 
 		 790 aa  230  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 		 850 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 1048 aa  229  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  38.5 
 
 		 1022 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.31 
 
 		 838 aa  227  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 993 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 		 967 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 1011 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  42.66 
 
 		 1014 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 946 aa  217  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 965 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  31.77 
 
 		 814 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.07 
 
 		 992 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 993 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  31.95 
 
 		 915 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.47 
 
 		 783 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 757 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.59 
 
 		 797 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.38 
 
 		 1027 aa  207  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 1030 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.97 
 
 		 1108 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 907 aa  204  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.76 
 
 		 770 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.61 
 
 		 928 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 		 940 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  29.48 
 
 		 806 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 908 aa  201  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.53 
 
 		 934 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 970 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.27 
 
 		 990 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 1071 aa  196  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  29.36 
 
 		 741 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.92 
 
 		 921 aa  196  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 935 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.39 
 
 		 995 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 		 1021 aa  195  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  39.34 
 
 		 990 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 982 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 1088 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.79 
 
 		 775 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  40.87 
 
 		 1001 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.8 
 
 		 921 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 963 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.87 
 
 		 1010 aa  191  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  37.38 
 
 		 1030 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  41.24 
 
 		 1024 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 956 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.87 
 
 		 928 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 971 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 930 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  38.42 
 
 		 1033 aa  184  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.8 
 
 		 1004 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  37.15 
 
 		 1003 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 983 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 		 792 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.92 
 
 		 1013 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  32.36 
 
 		 775 aa  179  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  36.38 
 
 		 937 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 907 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 1025 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.72 
 
 		 632 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.36 
 
 		 1138 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 742 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  37.38 
 
 		 810 aa  171  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.53 
 
 		 715 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  35.43 
 
 		 761 aa  168  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  28.97 
 
 		 954 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  37.35 
 
 		 690 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  31.99 
 
 		 910 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.34 
 
 		 1003 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  26.95 
 
 		 834 aa  164  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.98 
 
 		 1054 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  31.74 
 
 		 910 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  30.02 
 
 		 1060 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.13 
 
 		 950 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 680 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  30.58 
 
 		 827 aa  158  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.59 
 
 		 978 aa  157  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>