More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0205 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1088 aa  2075    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 1071 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 1025 aa  476  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.79 
 
 		 1030 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  40.37 
 
 		 989 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.76 
 
 		 1020 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.93 
 
 		 921 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  38.6 
 
 		 1054 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  40.54 
 
 		 931 aa  416  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 1022 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 990 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 1048 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 934 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 		 1010 aa  386  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.38 
 
 		 990 aa  386  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.02 
 
 		 915 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.67 
 
 		 940 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.38 
 
 		 950 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 1003 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.27 
 
 		 1027 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 981 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  40.45 
 
 		 995 aa  373  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  34.48 
 
 		 946 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.92 
 
 		 928 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 1033 aa  366  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 956 aa  366  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.27 
 
 		 970 aa  364  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 993 aa  362  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.49 
 
 		 965 aa  359  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 919 aa  357  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1108 aa  354  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  36.01 
 
 		 1003 aa  353  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 996 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 962 aa  347  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.24 
 
 		 1003 aa  344  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 913 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 965 aa  341  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 921 aa  340  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 941 aa  339  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.98 
 
 		 992 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.27 
 
 		 935 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 1017 aa  338  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 967 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 1021 aa  334  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.56 
 
 		 1013 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 908 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 928 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 971 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  38.42 
 
 		 983 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 1030 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 964 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 992 aa  323  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 993 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.91 
 
 		 775 aa  322  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.01 
 
 		 1001 aa  321  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 982 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 937 aa  315  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 1008 aa  313  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 1138 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 		 907 aa  313  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 954 aa  311  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.13 
 
 		 1022 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 621 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 930 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 963 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  37.15 
 
 		 978 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  36.49 
 
 		 788 aa  305  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 1011 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 654 aa  293  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 994 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  42.65 
 
 		 496 aa  291  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  45.02 
 
 		 453 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  40.23 
 
 		 632 aa  285  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  35.64 
 
 		 797 aa  282  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  34.63 
 
 		 790 aa  278  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 850 aa  278  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  36.87 
 
 		 715 aa  277  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 1319 aa  273  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 981 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  41.9 
 
 		 1024 aa  270  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.61 
 
 		 1025 aa  269  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  36.29 
 
 		 910 aa  266  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  40.94 
 
 		 926 aa  266  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1034 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 582 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 755 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 1346 aa  245  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 621 aa  243  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  34.05 
 
 		 783 aa  242  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  37.4 
 
 		 612 aa  241  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.47 
 
 		 741 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.93 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.98 
 
 		 915 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 775 aa  236  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 666 aa  231  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 1004 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  36.19 
 
 		 838 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  49.83 
 
 		 378 aa  229  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.81 
 
 		 631 aa  228  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>