More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2430 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 612 aa  1195    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  43.12 
 
 		 775 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 654 aa  332  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 1022 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.08 
 
 		 1025 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 990 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.81 
 
 		 981 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 934 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  38.45 
 
 		 1021 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.23 
 
 		 950 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 971 aa  270  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.64 
 
 		 1003 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 954 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.64 
 
 		 1025 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 1010 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 996 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 992 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 1003 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 1022 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 		 990 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.01 
 
 		 1138 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 963 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 931 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.88 
 
 		 1014 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 1319 aa  247  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 1017 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  40.29 
 
 		 1024 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 940 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.72 
 
 		 1088 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.22 
 
 		 994 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.25 
 
 		 921 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  44.14 
 
 		 1108 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 1033 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 1071 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 1030 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 910 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 1346 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 913 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 941 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 632 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.62 
 
 		 992 aa  220  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 1013 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 1001 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 946 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.02 
 
 		 995 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 930 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 1027 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 921 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 910 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 1034 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 989 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 1054 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 993 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 1020 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 453 aa  210  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 926 aa  210  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 964 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 666 aa  209  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 935 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  42.61 
 
 		 788 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 970 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 919 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 1011 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 981 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 983 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 928 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  37.43 
 
 		 783 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 1048 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 		 928 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 907 aa  190  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.12 
 
 		 908 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 956 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 965 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 993 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 962 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.68 
 
 		 496 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.93 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.73 
 
 		 915 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 1008 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  38.84 
 
 		 896 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 1003 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.58 
 
 		 965 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  39.63 
 
 		 761 aa  174  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  39.47 
 
 		 790 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  39.94 
 
 		 806 aa  170  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  37.94 
 
 		 797 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 850 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.01 
 
 		 915 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  30.24 
 
 		 967 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  39 
 
 		 715 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.84 
 
 		 982 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 622 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 		 597 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  39.49 
 
 		 792 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  39.88 
 
 		 680 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  43.51 
 
 		 1004 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 1030 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>