More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0385 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 940 aa  1777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.05 
 
 		 931 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.18 
 
 		 1025 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 946 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.1 
 
 		 921 aa  383  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 981 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 1020 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 1071 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 1027 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 1022 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.68 
 
 		 1010 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.61 
 
 		 921 aa  363  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  40.42 
 
 		 1030 aa  361  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.44 
 
 		 1088 aa  360  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 919 aa  353  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.12 
 
 		 990 aa  353  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 941 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  39.9 
 
 		 1003 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 1017 aa  350  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 1021 aa  343  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  41.63 
 
 		 1014 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 950 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 		 1011 aa  340  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 970 aa  337  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 934 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 971 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.51 
 
 		 913 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 965 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  38.99 
 
 		 995 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 1108 aa  327  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 996 aa  327  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.06 
 
 		 992 aa  324  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  38.34 
 
 		 990 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 954 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 992 aa  320  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 		 956 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 928 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  36.64 
 
 		 930 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 907 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 1022 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 1048 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 962 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.31 
 
 		 1003 aa  313  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 654 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 1008 aa  300  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  39.37 
 
 		 1033 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.78 
 
 		 989 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 		 983 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 908 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 		 967 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 1054 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 965 aa  290  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 964 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 1003 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 993 aa  287  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 1001 aa  287  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 1013 aa  287  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  45.06 
 
 		 496 aa  286  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.3 
 
 		 1025 aa  283  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33 
 
 		 1346 aa  281  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 928 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  41.25 
 
 		 582 aa  277  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  33.75 
 
 		 1030 aa  277  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 926 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 935 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 937 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.89 
 
 		 1034 aa  273  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.49 
 
 		 621 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 850 aa  268  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  35.88 
 
 		 1004 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 1138 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 1319 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.95 
 
 		 788 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 		 963 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  38.41 
 
 		 910 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 978 aa  253  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 982 aa  251  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 775 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 915 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 453 aa  245  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  40.86 
 
 		 1024 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 981 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 632 aa  242  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.96 
 
 		 631 aa  241  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 993 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  40.62 
 
 		 994 aa  234  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  43.93 
 
 		 1102 aa  229  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  32.28 
 
 		 806 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.39 
 
 		 666 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.09 
 
 		 790 aa  222  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.19 
 
 		 797 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 1000 aa  218  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  48.54 
 
 		 378 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 915 aa  215  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  33.58 
 
 		 715 aa  210  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 910 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.74 
 
 		 960 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 621 aa  204  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>