More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0857 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  71.97 
 
 		 859 aa  926    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  70.55 
 
 		 897 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1000 aa  1945    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  71.37 
 
 		 900 aa  973    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  77.59 
 
 		 992 aa  970    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  41.54 
 
 		 934 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  45.87 
 
 		 675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  36.88 
 
 		 845 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  42.11 
 
 		 829 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1383 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  35.16 
 
 		 1500 aa  373  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  37.16 
 
 		 1309 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  34.43 
 
 		 843 aa  364  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  34.19 
 
 		 838 aa  360  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  36.96 
 
 		 1324 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  34.35 
 
 		 849 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  32.96 
 
 		 1314 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  39.78 
 
 		 899 aa  317  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1523 aa  311  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.03 
 
 		 1056 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1068 aa  294  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.81 
 
 		 963 aa  276  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 911 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  33.86 
 
 		 1509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  32.54 
 
 		 1311 aa  270  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 785 aa  259  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1039 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  34.89 
 
 		 686 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 940 aa  218  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.02 
 
 		 981 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 		 1326 aa  207  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.75 
 
 		 713 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 1319 aa  205  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  57.82 
 
 		 234 aa  205  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 		 969 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.37 
 
 		 801 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 1346 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 453 aa  201  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  41.56 
 
 		 1102 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.95 
 
 		 621 aa  199  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 1022 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 990 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 1108 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1010 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 957 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.12 
 
 		 960 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.97 
 
 		 1030 aa  194  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  43.83 
 
 		 378 aa  194  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 995 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 1100 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.39 
 
 		 1025 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.14 
 
 		 1092 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 965 aa  189  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.09 
 
 		 496 aa  189  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 1010 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 950 aa  188  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 1003 aa  187  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 1003 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.35 
 
 		 1056 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  40.63 
 
 		 1123 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 996 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 		 1288 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  44.23 
 
 		 833 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  38.99 
 
 		 934 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  44.8 
 
 		 1733 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 1020 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 1424 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.49 
 
 		 921 aa  184  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 		 956 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.33 
 
 		 1261 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 1050 aa  183  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  45.42 
 
 		 919 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 1110 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  47.04 
 
 		 1118 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  36.98 
 
 		 954 aa  182  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.29 
 
 		 1055 aa  182  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.05 
 
 		 983 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 1014 aa  181  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 857 aa  181  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 952 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 268 aa  180  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1283 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.48 
 
 		 1017 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  41.24 
 
 		 1186 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.66 
 
 		 1125 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1088 aa  178  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 622 aa  178  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  41.96 
 
 		 267 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  44.4 
 
 		 489 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.23 
 
 		 992 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 		 1128 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.1 
 
 		 1058 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 1043 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  26.06 
 
 		 1262 aa  174  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 654 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.98 
 
 		 915 aa  173  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 981 aa  172  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1058 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  41.07 
 
 		 1339 aa  170  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.11 
 
 		 1036 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>