240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1471 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1283 aa  2639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1039 aa  299  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 911 aa  272  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.05 
 
 		 1288 aa  269  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1105 aa  264  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.31 
 
 		 1328 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 1262 aa  260  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 1185 aa  252  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 1424 aa  250  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1215 aa  243  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 		 1050 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1068 aa  238  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  32.97 
 
 		 1488 aa  225  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 785 aa  224  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 924 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 767 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 885 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 787 aa  195  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.96 
 
 		 1507 aa  191  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 		 1128 aa  191  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  24.11 
 
 		 1056 aa  191  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 454 aa  191  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1088 aa  191  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 771 aa  188  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 1186 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.28 
 
 		 725 aa  186  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.65 
 
 		 1044 aa  185  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  24.72 
 
 		 934 aa  184  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  27.09 
 
 		 845 aa  184  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 		 1146 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  25.44 
 
 		 1324 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 		 1125 aa  175  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  25.41 
 
 		 843 aa  174  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  24.89 
 
 		 1500 aa  174  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.25 
 
 		 1131 aa  171  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  26.3 
 
 		 900 aa  170  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  27.82 
 
 		 799 aa  168  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  26.86 
 
 		 1000 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  25.23 
 
 		 801 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  26.13 
 
 		 963 aa  166  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 843 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 837 aa  163  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  26.2 
 
 		 849 aa  162  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  26.89 
 
 		 713 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 568 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.19 
 
 		 568 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  25.69 
 
 		 675 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  25.6 
 
 		 992 aa  152  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  26.49 
 
 		 859 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 953 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  23.01 
 
 		 1309 aa  150  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.45 
 
 		 828 aa  149  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  25.82 
 
 		 897 aa  147  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.86 
 
 		 1475 aa  147  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.5 
 
 		 825 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.82 
 
 		 672 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.75 
 
 		 838 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  24.06 
 
 		 1314 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 751 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  26.39 
 
 		 1468 aa  134  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 444 aa  132  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 1290 aa  131  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.61 
 
 		 991 aa  131  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 857 aa  129  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 814 aa  129  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.54 
 
 		 822 aa  128  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 		 919 aa  127  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.3 
 
 		 2145 aa  127  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 284 aa  126  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 481 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  24.01 
 
 		 1509 aa  122  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 776 aa  122  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.34 
 
 		 493 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  25.1 
 
 		 899 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 		 577 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 1040 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  29.83 
 
 		 977 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  24.26 
 
 		 829 aa  115  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 		 1136 aa  114  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  28.91 
 
 		 680 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.26 
 
 		 362 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  25.15 
 
 		 1311 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  30.8 
 
 		 311 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.52 
 
 		 1550 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.58 
 
 		 732 aa  108  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1523 aa  107  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 443 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 		 304 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1383 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  26.12 
 
 		 457 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 949 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 1435 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  33.52 
 
 		 212 aa  99.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1010 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 		 968 aa  96.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  19.6 
 
 		 1404 aa  94.7  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.89 
 
 		 841 aa  94.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 966 aa  94.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1212 aa  92.8  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1028 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>