200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0434 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 
713 aa  1411    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  41.22 
 
 
934 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  33.71 
 
 
1068 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.32 
 
 
675 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  32.9 
 
 
900 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
911 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
1262 aa  223  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.66 
 
 
1056 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.23 
 
 
1039 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 
1000 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  32.76 
 
 
897 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  30.52 
 
 
845 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
1088 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  33.14 
 
 
847 aa  203  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.03 
 
 
963 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.05 
 
 
992 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.4 
 
 
1324 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
785 aa  200  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
1185 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1105 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 
1050 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  27.87 
 
 
1500 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.84 
 
 
899 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  31.47 
 
 
859 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  32.92 
 
 
801 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.04 
 
 
1424 aa  194  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.85 
 
 
829 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  28.35 
 
 
843 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
1128 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.75 
 
 
828 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.32 
 
 
1309 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  29.44 
 
 
849 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
924 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 
1125 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  27.72 
 
 
1314 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
776 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
1283 aa  174  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  28.35 
 
 
838 aa  173  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
953 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.53 
 
 
1311 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
1288 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
837 aa  157  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
857 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  31.53 
 
 
1488 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 
767 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  24.31 
 
 
1523 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.42 
 
 
1328 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 
454 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.83 
 
 
1131 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.87 
 
 
793 aa  138  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  26.63 
 
 
1509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
814 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
1215 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  25.07 
 
 
1383 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
966 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.42 
 
 
568 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
568 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 
284 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
843 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 
577 aa  124  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  32.22 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  25.13 
 
 
1261 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.75 
 
 
991 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.79 
 
 
825 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.78 
 
 
672 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
751 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 
1146 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 
1186 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 
1136 aa  107  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.72 
 
 
919 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 
885 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  35.02 
 
 
702 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.65 
 
 
771 aa  104  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
304 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  28.71 
 
 
958 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 
787 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23 
 
 
822 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  25.44 
 
 
1468 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  28.48 
 
 
686 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  37.2 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.45 
 
 
1550 aa  90.9  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
949 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  35.18 
 
 
373 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21 
 
 
1212 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  25.94 
 
 
1326 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20 
 
 
1404 aa  84.3  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
444 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.48 
 
 
362 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
344 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  24.36 
 
 
1475 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  38 
 
 
358 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 
1290 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
481 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 
551 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.8 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25 
 
 
680 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.9 
 
 
732 aa  74.7  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  28.35 
 
 
918 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.92 
 
 
1106 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  31.61 
 
 
1017 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.104459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>