264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3483 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  100 
 
 
793 aa  1566    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
911 aa  239  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
785 aa  238  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  28.32 
 
 
934 aa  188  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.02 
 
 
1068 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  29.3 
 
 
859 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.79 
 
 
1039 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.73 
 
 
899 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.85 
 
 
1056 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  28.14 
 
 
900 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  29.83 
 
 
992 aa  165  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  29.64 
 
 
897 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.78 
 
 
801 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
1088 aa  150  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 
1424 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  27.31 
 
 
829 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  27.27 
 
 
845 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.38 
 
 
1523 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  23.8 
 
 
1500 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  30.49 
 
 
385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  29.19 
 
 
1000 aa  128  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.15 
 
 
1324 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  26.86 
 
 
713 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  26.87 
 
 
843 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
814 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  26.24 
 
 
675 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  27.12 
 
 
1010 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  22.12 
 
 
1288 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.09 
 
 
1131 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
1105 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.94 
 
 
767 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  23.82 
 
 
963 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  26.94 
 
 
838 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  25.57 
 
 
849 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  25.19 
 
 
1309 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 
1125 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  26.53 
 
 
1509 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
857 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.76 
 
 
828 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 
1146 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
1185 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.12 
 
 
1212 aa  105  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.32 
 
 
672 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  26.76 
 
 
457 aa  96.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
751 aa  94.4  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  25.06 
 
 
1314 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
454 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.02 
 
 
825 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  30.94 
 
 
311 aa  92  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  24.2 
 
 
1261 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  23.53 
 
 
1383 aa  91.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
1283 aa  91.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.53 
 
 
1262 aa  90.9  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
949 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  32.78 
 
 
266 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
953 aa  87.8  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
284 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.6 
 
 
1550 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  33.69 
 
 
702 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.21 
 
 
1050 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.35 
 
 
2145 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  25.86 
 
 
1027 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  22.07 
 
 
1128 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  33.14 
 
 
238 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  38.28 
 
 
374 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  36.15 
 
 
235 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 
1326 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
850 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
837 aa  77.4  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
924 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.13 
 
 
680 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
966 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  34.94 
 
 
237 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  25.66 
 
 
958 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.14 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.21 
 
 
1328 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  36.92 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 
787 aa  74.7  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.46 
 
 
822 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.35 
 
 
1404 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
776 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  26.99 
 
 
1311 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  31.55 
 
 
358 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.89 
 
 
1901 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  32.53 
 
 
705 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  23.96 
 
 
686 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1215 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
991 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.16 
 
 
1228 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 
1136 aa  71.6  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
640 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  25.66 
 
 
965 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 
771 aa  71.2  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  35.43 
 
 
157 aa  71.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  23.63 
 
 
2413 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
443 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
568 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 
568 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 
1186 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>