279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1729 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 837 aa  1670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0395  hypothetical protein  64.48 
 
 		 488 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  39.78 
 
 		 702 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 		 1262 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.28 
 
 		 1186 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  36.72 
 
 		 1050 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1068 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.43 
 
 		 767 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  34.78 
 
 		 1328 aa  230  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  37.46 
 
 		 1488 aa  230  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  37.3 
 
 		 1185 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.14 
 
 		 828 aa  220  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 		 1288 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 843 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 1215 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 1105 aa  201  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 454 aa  198  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  35.4 
 
 		 1128 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.87 
 
 		 1424 aa  190  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  40.69 
 
 		 298 aa  188  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 924 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 		 1125 aa  184  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  39.39 
 
 		 672 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  41.45 
 
 		 963 aa  181  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.58 
 
 		 1040 aa  181  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1039 aa  180  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 		 568 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 568 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  33.04 
 
 		 1131 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 444 aa  172  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 776 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 		 1507 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  30.81 
 
 		 725 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.18 
 
 		 799 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 911 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 857 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  35.03 
 
 		 1056 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  34.64 
 
 		 1324 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27 
 
 		 2145 aa  164  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.26 
 
 		 1044 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  33.72 
 
 		 713 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 1290 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1283 aa  156  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1550 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 		 991 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 751 aa  152  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 		 577 aa  150  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 		 885 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1088 aa  148  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 771 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.23 
 
 		 841 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.83 
 
 		 825 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 787 aa  144  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.6 
 
 		 822 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 284 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  33.2 
 
 		 680 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 1475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.87 
 
 		 1314 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 481 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.58 
 
 		 732 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.75 
 
 		 801 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  30.72 
 
 		 934 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.75 
 
 		 919 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  35.6 
 
 		 899 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  32.43 
 
 		 977 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  30.48 
 
 		 1468 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1383 aa  127  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  31.7 
 
 		 1311 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  28.49 
 
 		 1106 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  38.43 
 
 		 675 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 953 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 814 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  27.65 
 
 		 686 aa  120  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 		 785 aa  120  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  32.27 
 
 		 847 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  38.99 
 
 		 829 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  26.82 
 
 		 845 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  31.14 
 
 		 838 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.51 
 
 		 740 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2793  tetratricopeptide TPR_4  35.22 
 
 		 1024 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.91 
 
 		 362 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.84 
 
 		 1228 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.63 
 
 		 493 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 		 1435 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 949 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  38.42 
 
 		 304 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  29.1 
 
 		 1500 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 966 aa  109  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.78 
 
 		 859 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 1146 aa  107  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 1000 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  30.7 
 
 		 900 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.09 
 
 		 694 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1404 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1028 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 469 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  31.34 
 
 		 849 aa  103  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  29.79 
 
 		 311 aa  102  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.95 
 
 		 992 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1523 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>