More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3796 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 1040 aa  2128    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.29 
 
 		 2145 aa  549  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  34.99 
 
 		 1328 aa  340  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.56 
 
 		 1507 aa  335  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 1215 aa  300  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 885 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.54 
 
 		 787 aa  293  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 771 aa  290  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.22 
 
 		 1424 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 		 725 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1105 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 454 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.42 
 
 		 799 aa  247  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  26.78 
 
 		 1044 aa  245  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1550 aa  238  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.84 
 
 		 1022 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.32 
 
 		 1186 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 1056 aa  231  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 1290 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.47 
 
 		 988 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  30.13 
 
 		 782 aa  222  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.12 
 
 		 1056 aa  222  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 1288 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.97 
 
 		 767 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 924 aa  197  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.82 
 
 		 694 aa  196  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  35.2 
 
 		 825 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.69 
 
 		 740 aa  191  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1404 aa  189  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 843 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 949 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 878 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 568 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 568 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.7 
 
 		 2327 aa  184  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 444 aa  184  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  21.72 
 
 		 1050 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 911 aa  180  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 837 aa  179  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.99 
 
 		 732 aa  177  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.83 
 
 		 828 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.21 
 
 		 818 aa  177  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1088 aa  177  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1039 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.9 
 
 		 784 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.13 
 
 		 708 aa  168  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 		 985 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.77 
 
 		 919 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.53 
 
 		 836 aa  162  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.56 
 
 		 810 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  33.22 
 
 		 919 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  22.59 
 
 		 1185 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.26 
 
 		 1106 aa  155  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25.4 
 
 		 1056 aa  155  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 953 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 857 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1068 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.68 
 
 		 1131 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 991 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.31 
 
 		 1262 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  23.96 
 
 		 1475 aa  148  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 284 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1212 aa  146  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.05 
 
 		 493 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 751 aa  145  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  20.61 
 
 		 1468 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  28.53 
 
 		 822 aa  144  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 814 aa  144  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1261 aa  144  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  31.36 
 
 		 1228 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.76 
 
 		 686 aa  142  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  22.76 
 
 		 1488 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  31.43 
 
 		 963 aa  141  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 362 aa  140  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.69 
 
 		 672 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.15 
 
 		 807 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  28.9 
 
 		 977 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 966 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 443 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1060 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1028 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.97 
 
 		 680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  33.33 
 
 		 311 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.31 
 
 		 1266 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 481 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.61 
 
 		 957 aa  119  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 785 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 991 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1283 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1238 aa  116  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 		 190 aa  116  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1911 aa  115  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  23.74 
 
 		 731 aa  115  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.82 
 
 		 1429 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 		 1737 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  28.02 
 
 		 801 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  21.67 
 
 		 1128 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.31 
 
 		 2240 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  22.98 
 
 		 757 aa  111  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>