More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2526 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  100 
 
 
732 aa  1483    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  61.49 
 
 
795 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  60.08 
 
 
1123 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  38.86 
 
 
395 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  36.19 
 
 
1328 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
1215 aa  253  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.2 
 
 
1186 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
1288 aa  238  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
878 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.02 
 
 
2145 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.16 
 
 
810 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
909 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
924 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 
1507 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.76 
 
 
771 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  36.05 
 
 
493 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  40.73 
 
 
843 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  38.75 
 
 
825 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  37.15 
 
 
816 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
1105 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 
568 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.05 
 
 
568 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 
787 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 
885 aa  205  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
681 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  37.54 
 
 
685 aa  200  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.66 
 
 
767 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
927 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  34.41 
 
 
349 aa  194  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.05 
 
 
1611 aa  189  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.88 
 
 
1550 aa  189  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.22 
 
 
1039 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
284 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.27 
 
 
1676 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 
1424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
911 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  33.88 
 
 
1131 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.73 
 
 
1694 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
649 aa  178  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
637 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 
1040 aa  177  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
714 aa  177  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  37.89 
 
 
919 aa  177  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.99 
 
 
991 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.51 
 
 
865 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
543 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
362 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 
725 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 
714 aa  171  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
1088 aa  167  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
481 aa  167  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
1119 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.64 
 
 
725 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
847 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  35.23 
 
 
672 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
751 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  38.6 
 
 
680 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  31.42 
 
 
1044 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 
1276 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
949 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.78 
 
 
603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  32.94 
 
 
362 aa  154  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.18 
 
 
1404 aa  154  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.75 
 
 
632 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
739 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.63 
 
 
1056 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.95 
 
 
1056 aa  150  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  29.66 
 
 
799 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  36.09 
 
 
977 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.22 
 
 
1022 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.39 
 
 
1238 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
814 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  23.26 
 
 
1087 aa  144  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.74 
 
 
740 aa  144  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
1290 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.83 
 
 
2240 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  28.88 
 
 
694 aa  141  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
3172 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  31.64 
 
 
919 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 
4489 aa  140  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 
1262 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  29.93 
 
 
1098 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
443 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
750 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
1069 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
953 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
955 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
857 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
576 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
4079 aa  137  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  29.39 
 
 
822 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
639 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0419  hypothetical protein  61.06 
 
 
122 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.831767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
612 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.54 
 
 
1979 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  33.88 
 
 
311 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 
1519 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>