More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0416 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
481 aa  984    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  63.94 
 
 
568 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  63.94 
 
 
568 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.37 
 
 
767 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  48.18 
 
 
1328 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  66.36 
 
 
672 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  56.2 
 
 
1215 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  57.2 
 
 
843 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  52.36 
 
 
919 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.53 
 
 
1186 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  64.45 
 
 
680 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  59.46 
 
 
977 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  49.59 
 
 
751 aa  236  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  51.05 
 
 
725 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  55.36 
 
 
1507 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  53.81 
 
 
799 aa  229  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  48.56 
 
 
454 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  47.48 
 
 
1044 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  54.79 
 
 
911 aa  219  8.999999999999998e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.29 
 
 
771 aa  216  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  51.36 
 
 
1039 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  51.89 
 
 
444 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.96 
 
 
1424 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  46.19 
 
 
311 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  46.54 
 
 
1105 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 
924 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  47.98 
 
 
825 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.23 
 
 
787 aa  199  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  52.05 
 
 
785 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.93 
 
 
885 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  48.73 
 
 
212 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  38.64 
 
 
362 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  47.6 
 
 
284 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  42.97 
 
 
822 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  42.36 
 
 
1262 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  44.39 
 
 
1488 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  57.62 
 
 
162 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  42.44 
 
 
1185 aa  173  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  40.74 
 
 
1050 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 
1128 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.95 
 
 
991 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  48.09 
 
 
190 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  39.02 
 
 
732 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  42.66 
 
 
304 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  36.4 
 
 
1288 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  41.94 
 
 
493 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  41.15 
 
 
2145 aa  160  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  39.71 
 
 
1550 aa  157  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 
814 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
953 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  35.25 
 
 
1131 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 
443 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  38.86 
 
 
1125 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  30.14 
 
 
1404 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 
837 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.09 
 
 
854 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
1475 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
1028 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.47 
 
 
1068 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
949 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  35.07 
 
 
1212 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  37.09 
 
 
1290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  35.48 
 
 
1228 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
669 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 
667 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
1146 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
1283 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
1479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.12 
 
 
1040 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 
577 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
966 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
776 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
937 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.74 
 
 
828 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  34.8 
 
 
1106 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  33.49 
 
 
694 aa  116  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.15 
 
 
919 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 
857 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 
968 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 
1136 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.3 
 
 
801 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  36.6 
 
 
178 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.72 
 
 
963 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.75 
 
 
740 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.55 
 
 
1056 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
1054 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
1088 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.97 
 
 
2413 aa  106  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.51 
 
 
782 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.66 
 
 
675 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.36 
 
 
1036 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  33.03 
 
 
1238 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1060  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
450 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
272 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
1435 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
851 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  32.37 
 
 
829 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 
649 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 
1415 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>