More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0540 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  66.25 
 
 		 988 aa  1258    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  73.49 
 
 		 1022 aa  1477    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1056 aa  2113    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  68.3 
 
 		 784 aa  1003    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  63.13 
 
 		 1056 aa  1281    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  67.34 
 
 		 818 aa  1035    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 927 aa  433  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 		 878 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.24 
 
 		 1694 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1276 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.58 
 
 		 629 aa  347  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 4079 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 605 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 		 392 aa  311  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  43.22 
 
 		 649 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1421 aa  294  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  37.59 
 
 		 462 aa  291  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1676 aa  289  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 		 617 aa  282  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 543 aa  280  9e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 1737 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1049 aa  268  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  52.11 
 
 		 778 aa  262  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.7 
 
 		 839 aa  262  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  40.28 
 
 		 706 aa  260  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1138 aa  257  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.19 
 
 		 718 aa  253  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  38.9 
 
 		 706 aa  251  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.19 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  56.28 
 
 		 619 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1069 aa  247  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.02 
 
 		 495 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 562 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.44 
 
 		 479 aa  241  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.52 
 
 		 1979 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.05 
 
 		 708 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.08 
 
 		 1056 aa  235  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 847 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 3172 aa  231  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 450 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 632 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 602 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 		 1040 aa  221  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 556 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 2240 aa  218  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 750 aa  217  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  39.78 
 
 		 750 aa  215  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 425 aa  214  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.12 
 
 		 746 aa  211  9e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 		 361 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1154 aa  206  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.74 
 
 		 738 aa  204  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.24 
 
 		 564 aa  204  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 371 aa  201  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 1486 aa  201  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 804 aa  201  7e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.54 
 
 		 887 aa  200  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.92 
 
 		 573 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 3301 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 4489 aa  197  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 687 aa  197  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 		 331 aa  195  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 		 576 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38.68 
 
 		 334 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 591 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.08 
 
 		 782 aa  192  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 3145 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 543 aa  187  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.36 
 
 		 936 aa  187  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  41.3 
 
 		 581 aa  187  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.48 
 
 		 582 aa  187  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 486 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1371 aa  186  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1094 aa  185  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.28 
 
 		 635 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 306 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.4 
 
 		 733 aa  180  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 740 aa  178  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  44.21 
 
 		 486 aa  177  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 284 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 366 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1054 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.44 
 
 		 689 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.88 
 
 		 490 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.33 
 
 		 373 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  40.78 
 
 		 820 aa  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 935 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 985 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 		 357 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 471 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.96 
 
 		 1067 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 		 758 aa  173  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  43.53 
 
 		 477 aa  171  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.51 
 
 		 2145 aa  171  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 		 404 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 955 aa  170  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 784 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.73 
 
 		 406 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>