More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2322 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  58.36 
 
 		 955 aa  1040    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 935 aa  1883    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  40.63 
 
 		 662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 740 aa  343  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.14 
 
 		 714 aa  325  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 3145 aa  321  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.71 
 
 		 608 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 681 aa  317  7e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 747 aa  317  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 714 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 1827 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 689 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 637 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 615 aa  297  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 688 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.6 
 
 		 620 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 1450 aa  287  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 		 626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 601 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 620 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 578 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.9 
 
 		 577 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 747 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 574 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 767 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 523 aa  273  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  36.74 
 
 		 1677 aa  273  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 612 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.77 
 
 		 603 aa  267  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.65 
 
 		 1694 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.39 
 
 		 626 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 1276 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 614 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 646 aa  265  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 649 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 649 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 639 aa  263  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.07 
 
 		 626 aa  263  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 542 aa  261  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 637 aa  260  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.06 
 
 		 614 aa  260  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.06 
 
 		 614 aa  260  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 614 aa  260  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.07 
 
 		 648 aa  260  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 1038 aa  258  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 635 aa  257  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 653 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.3 
 
 		 653 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 635 aa  257  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.38 
 
 		 1077 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 412 aa  254  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 611 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 878 aa  244  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 556 aa  243  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 583 aa  241  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.57 
 
 		 703 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  38.52 
 
 		 473 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 615 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.51 
 
 		 760 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 543 aa  238  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.44 
 
 		 810 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 472 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.67 
 
 		 733 aa  232  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 484 aa  230  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 438 aa  229  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 520 aa  227  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1212 aa  227  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.89 
 
 		 1034 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  34.84 
 
 		 503 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 1005 aa  224  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  36 
 
 		 872 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 527 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 909 aa  222  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 780 aa  220  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 592 aa  220  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 927 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 457 aa  217  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 529 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 655 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 		 604 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 607 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 		 454 aa  215  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  31.36 
 
 		 630 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.8 
 
 		 1022 aa  213  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 558 aa  211  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 4489 aa  208  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 607 aa  208  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.73 
 
 		 1764 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 		 545 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 1979 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 562 aa  205  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 		 1056 aa  204  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 784 aa  202  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.95 
 
 		 988 aa  201  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.58 
 
 		 818 aa  201  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 1094 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>