More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0987 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
611 aa  1195    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  77.67 
 
 
626 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  66.18 
 
 
620 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  77.67 
 
 
614 aa  917    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  98.53 
 
 
635 aa  1157    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  77.67 
 
 
626 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  66.34 
 
 
615 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  94.13 
 
 
637 aa  1102    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  91.99 
 
 
636 aa  1086    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  91.83 
 
 
612 aa  1078    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  92.45 
 
 
639 aa  1076    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  77.29 
 
 
626 aa  920    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  77.83 
 
 
614 aa  896    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  66.5 
 
 
620 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  77.83 
 
 
614 aa  918    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  98.53 
 
 
635 aa  1157    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  77.67 
 
 
614 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  77.67 
 
 
614 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
740 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 
601 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 
602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.43 
 
 
689 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  38.69 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
681 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
1827 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
3145 aa  280  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 
574 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
714 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
592 aa  270  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.88 
 
 
577 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
578 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
637 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.72 
 
 
648 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.27 
 
 
1034 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.49 
 
 
714 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
955 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
935 aa  251  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
688 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
1005 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
1450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
767 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 
523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
662 aa  240  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
1454 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
1451 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.11 
 
 
615 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.64 
 
 
703 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
780 aa  227  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.68 
 
 
1677 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
1212 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 
520 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.02 
 
 
653 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.69 
 
 
603 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
653 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
529 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
646 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 
556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
1038 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.66 
 
 
810 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
747 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
649 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
649 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
636 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
438 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.8 
 
 
733 aa  207  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 
878 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
505 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
583 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 
412 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 
604 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
595 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.5 
 
 
1077 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.13 
 
 
540 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
607 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.86 
 
 
1764 aa  193  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.41 
 
 
473 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
3035 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 
760 aa  187  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
607 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  28.89 
 
 
630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
484 aa  183  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
4489 aa  183  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.99 
 
 
1694 aa  181  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.86 
 
 
872 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 
545 aa  180  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  34.23 
 
 
600 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
545 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
496 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 
595 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.37 
 
 
545 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.84 
 
 
550 aa  178  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
573 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.1 
 
 
546 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
566 aa  177  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>