More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3330 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1038 aa  2128    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 1450 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1827 aa  544  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 3145 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  37.26 
 
 		 1005 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.79 
 
 		 1034 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 688 aa  433  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.9 
 
 		 1677 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.87 
 
 		 760 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 923 aa  330  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 578 aa  327  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  42.75 
 
 		 412 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  38.11 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  40.52 
 
 		 523 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 601 aa  300  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 602 aa  297  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.35 
 
 		 608 aa  295  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 		 1212 aa  291  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 767 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.97 
 
 		 703 aa  288  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.24 
 
 		 653 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 653 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.76 
 
 		 454 aa  283  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.46 
 
 		 740 aa  281  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.58 
 
 		 648 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.99 
 
 		 1764 aa  275  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 620 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 780 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.53 
 
 		 620 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 689 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  40.1 
 
 		 872 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 484 aa  263  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 955 aa  263  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 		 529 aa  262  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 615 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 747 aa  261  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.95 
 
 		 636 aa  258  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 637 aa  258  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  39.85 
 
 		 747 aa  258  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 		 556 aa  257  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.66 
 
 		 473 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 935 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 593 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 662 aa  251  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 520 aa  251  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 559 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.49 
 
 		 503 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 438 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 472 aa  245  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 611 aa  243  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 545 aa  240  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  45.61 
 
 		 387 aa  240  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 546 aa  240  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 457 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.72 
 
 		 714 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 607 aa  239  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 545 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 545 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 588 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.1 
 
 		 615 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 681 aa  232  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 571 aa  231  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 505 aa  230  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 649 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.4 
 
 		 626 aa  230  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 649 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 573 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 540 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.33 
 
 		 600 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 496 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.9 
 
 		 603 aa  228  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 592 aa  225  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 		 1073 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  33.12 
 
 		 546 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  39.8 
 
 		 360 aa  222  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 545 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 714 aa  221  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 612 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 536 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 639 aa  219  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 614 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.86 
 
 		 626 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 595 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 626 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 558 aa  218  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  217  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.32 
 
 		 1077 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 636 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 637 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.96 
 
 		 389 aa  212  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 611 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 635 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 635 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>