More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2752 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  72.89 
 
 		 588 aa  804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  82.1 
 
 		 593 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  85.74 
 
 		 571 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  98.35 
 
 		 545 aa  1056    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  85.64 
 
 		 573 aa  830    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  85.64 
 
 		 600 aa  834    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 545 aa  1077    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  86.73 
 
 		 496 aa  802    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  58.68 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.46 
 
 		 545 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  56.07 
 
 		 545 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  55.81 
 
 		 559 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  57.72 
 
 		 536 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  45 
 
 		 607 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  49.64 
 
 		 711 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  49.64 
 
 		 598 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  47.09 
 
 		 705 aa  342  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  49.64 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 1038 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  38.56 
 
 		 602 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  38.07 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 688 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.79 
 
 		 653 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 653 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.56 
 
 		 1764 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 1450 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 578 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.34 
 
 		 703 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 523 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 740 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  35.73 
 
 		 577 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1827 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  39.09 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.81 
 
 		 1034 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  36.42 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 767 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 689 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  36.04 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  39.28 
 
 		 492 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 1005 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 1212 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 649 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 649 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.57 
 
 		 1077 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.06 
 
 		 872 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 747 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 780 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.51 
 
 		 1677 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 484 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.02 
 
 		 620 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 		 3145 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  41.43 
 
 		 747 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.54 
 
 		 473 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.96 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  39.69 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 457 aa  194  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 662 aa  194  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 529 aa  193  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 639 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 595 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.92 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.66 
 
 		 760 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 714 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 607 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 935 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 955 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  36.18 
 
 		 602 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  35.23 
 
 		 648 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 612 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 637 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.73 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  35.5 
 
 		 360 aa  183  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 636 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  35.67 
 
 		 389 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 714 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 583 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.3 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.3 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.3 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 614 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.56 
 
 		 626 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 614 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 611 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>