More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1635 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 502 aa  1013    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  97.61 
 
 		 502 aa  989    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  97.61 
 
 		 502 aa  989    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 546 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  44.08 
 
 		 556 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 473 aa  299  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 542 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.91 
 
 		 714 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  40.04 
 
 		 714 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  39.28 
 
 		 646 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 649 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 649 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.73 
 
 		 1677 aa  240  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.66 
 
 		 1077 aa  236  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 1005 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 1034 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 602 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 653 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.3 
 
 		 653 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 3145 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 688 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 608 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1450 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.57 
 
 		 540 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.79 
 
 		 603 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 523 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 574 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.2 
 
 		 689 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.14 
 
 		 703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 637 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 681 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 527 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  35.65 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 740 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 662 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.47 
 
 		 648 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1212 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 607 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.47 
 
 		 620 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 1454 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 1451 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.09 
 
 		 550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.77 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.42 
 
 		 1764 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 767 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 747 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1827 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 636 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 614 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 		 626 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 573 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 614 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 1038 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 626 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.05 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.77 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 780 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 583 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 620 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 923 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.28 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 935 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 		 558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 639 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.23 
 
 		 615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 571 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 593 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 612 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.19 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.53 
 
 		 872 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 636 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 760 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 1073 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 545 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 747 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7048  hypothetical protein  36.05 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0796926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 955 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  32.1 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>