More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6027 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  80.49 
 
 
593 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
571 aa  1130    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  85.74 
 
 
545 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  72.29 
 
 
588 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  88.4 
 
 
573 aa  887    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  89.7 
 
 
600 aa  901    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  90 
 
 
496 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  85.37 
 
 
545 aa  881    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  60.42 
 
 
546 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.34 
 
 
545 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  57.73 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  56.81 
 
 
559 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  58.47 
 
 
536 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 
611 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  44.42 
 
 
607 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  44.58 
 
 
705 aa  339  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  46.75 
 
 
711 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  46.75 
 
 
598 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  46.75 
 
 
598 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
1038 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 
688 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 
602 aa  230  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 
740 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.42 
 
 
577 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
1450 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 
601 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.55 
 
 
574 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
653 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.12 
 
 
703 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.04 
 
 
653 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
1827 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.4 
 
 
689 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
556 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 
767 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
487 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
608 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.54 
 
 
1764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.59 
 
 
1077 aa  214  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
780 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
520 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
747 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
592 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 
1034 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.46 
 
 
1677 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
3145 aa  207  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.19 
 
 
872 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  40.11 
 
 
488 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  37.73 
 
 
499 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.95 
 
 
620 aa  203  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.55 
 
 
473 aa  200  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
542 aa  200  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.19 
 
 
626 aa  200  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
607 aa  200  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 
747 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
484 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
1005 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 
529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.16 
 
 
714 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
472 aa  197  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  37.7 
 
 
602 aa  197  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
457 aa  197  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
649 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
649 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  37.85 
 
 
492 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  39.69 
 
 
387 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 
620 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 
639 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
1212 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 
615 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.12 
 
 
760 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
615 aa  193  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
646 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
438 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  36.39 
 
 
389 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
662 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.69 
 
 
648 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
714 aa  185  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.53 
 
 
604 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
595 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
612 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  36.91 
 
 
360 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  36.56 
 
 
602 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
637 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
636 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 
502 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
505 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
1454 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
1451 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
637 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 
935 aa  177  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  30.99 
 
 
525 aa  177  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
502 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  35.17 
 
 
502 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
614 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.9 
 
 
626 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.1 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.9 
 
 
614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>