More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1511 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 525 aa  1083    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  40.22 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  51.79 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 566 aa  273  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 599 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 662 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.32 
 
 		 1677 aa  210  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 1450 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.49 
 
 		 703 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 601 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 602 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 767 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1827 aa  193  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.08 
 
 		 733 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 646 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 		 636 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 935 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.65 
 
 		 689 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 3145 aa  187  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 649 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 649 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 509 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 615 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 740 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.43 
 
 		 648 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 688 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 574 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 636 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.65 
 
 		 626 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 607 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 1034 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 714 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1005 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 620 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1038 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.73 
 
 		 760 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 611 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  27.34 
 
 		 503 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 612 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.83 
 
 		 714 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 639 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 		 614 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 614 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 626 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 		 614 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 614 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.82 
 
 		 620 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 542 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  30.78 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 637 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 593 aa  173  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 588 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 		 604 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 923 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  34.11 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  33.23 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.91 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 635 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 635 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 457 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 747 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 611 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  34.98 
 
 		 705 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.69 
 
 		 1077 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  34.55 
 
 		 389 aa  167  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 546 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.37 
 
 		 872 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 595 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 955 aa  163  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 1212 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 653 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  26.45 
 
 		 653 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  30.48 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  34.93 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 607 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 496 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>