More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1965 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 595 aa  1219    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 599 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.55 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  28.54 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.71 
 
 		 733 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1450 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.18 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 688 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  28.96 
 
 		 714 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 547 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 3145 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1005 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 681 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 481 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 578 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 		 1034 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.23 
 
 		 603 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 608 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 935 aa  127  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 637 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 646 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 649 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 649 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  27.45 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  26.93 
 
 		 703 aa  120  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 955 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 740 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 		 540 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  26.98 
 
 		 577 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1827 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 502 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 		 502 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  25.05 
 
 		 1077 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 615 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 529 aa  107  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 626 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 780 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1038 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 545 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.09 
 
 		 760 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 878 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.91 
 
 		 626 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 		 810 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  25.58 
 
 		 1677 aa  97.8  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 909 aa  97.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 614 aa  97.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.86 
 
 		 626 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.84 
 
 		 454 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.05 
 
 		 620 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.86 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.86 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 767 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 612 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  26.2 
 
 		 509 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 509 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  26.2 
 
 		 509 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  26.2 
 
 		 509 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 595 aa  94.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  26.02 
 
 		 509 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 639 aa  94.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 607 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 592 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 509 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 509 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 637 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.02 
 
 		 816 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 545 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.76 
 
 		 632 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 636 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  25 
 
 		 546 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 685 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 635 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 530 aa  87.8  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 635 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 620 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 545 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 612 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>