More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2553 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 547 aa  1119    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.59 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 566 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  33.14 
 
 		 360 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 599 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 595 aa  160  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 525 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.94 
 
 		 733 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 714 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.09 
 
 		 714 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1827 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 935 aa  124  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1005 aa  124  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 608 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 740 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  25.15 
 
 		 653 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 653 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 574 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 509 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 509 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.41 
 
 		 1677 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 472 aa  113  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1038 aa  113  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.07 
 
 		 1034 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  26.29 
 
 		 703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.57 
 
 		 1077 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 767 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  26.9 
 
 		 577 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 688 aa  106  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 955 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 878 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  24.71 
 
 		 503 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 611 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 689 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 3145 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 545 aa  100  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 412 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 626 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 626 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 614 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 614 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 614 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 614 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 614 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 620 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 604 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  23.28 
 
 		 603 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.05 
 
 		 620 aa  94.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 505 aa  94.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 		 626 aa  94.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 637 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 662 aa  94  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 		 1486 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  26.46 
 
 		 872 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  27.08 
 
 		 546 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 593 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 601 aa  90.5  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 747 aa  90.5  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 615 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.39 
 
 		 1764 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 546 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 583 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 3035 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 1276 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 632 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 3560 aa  87.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 747 aa  87.4  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 543 aa  87  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 600 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.46 
 
 		 865 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 612 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.72 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>