More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0959 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  68.4 
 
 
626 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  68.03 
 
 
614 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  94.51 
 
 
620 aa  1171    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  67.64 
 
 
636 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  68.4 
 
 
639 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  66.5 
 
 
611 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  68.24 
 
 
626 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  68.35 
 
 
614 aa  801    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  67.1 
 
 
637 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  69.58 
 
 
626 aa  824    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  68.35 
 
 
614 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  68.35 
 
 
614 aa  802    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1235    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  76.38 
 
 
615 aa  920    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  67.92 
 
 
612 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  67.05 
 
 
635 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  68.35 
 
 
614 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  67.05 
 
 
635 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
740 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 
602 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 
601 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
608 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
689 aa  346  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
3145 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  36.63 
 
 
648 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
681 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 
574 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
767 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  36.33 
 
 
578 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
1450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.59 
 
 
577 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
1827 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
688 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.6 
 
 
1034 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
955 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.48 
 
 
703 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 
714 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
1005 aa  280  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
592 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
935 aa  279  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 
714 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 
615 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 
1212 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
556 aa  270  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
653 aa  267  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.89 
 
 
653 aa  267  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
1038 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.25 
 
 
603 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
542 aa  246  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 
780 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 
662 aa  243  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
520 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
747 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 
529 aa  239  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.02 
 
 
760 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.57 
 
 
1677 aa  236  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 
550 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.3 
 
 
1077 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 
412 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
646 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1451 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1454 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
649 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
649 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
472 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.96 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
583 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.05 
 
 
733 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
595 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
438 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  33.86 
 
 
540 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.22 
 
 
872 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 
454 aa  210  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  33.54 
 
 
503 aa  210  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
546 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.63 
 
 
810 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
505 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
878 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.48 
 
 
604 aa  203  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.81 
 
 
1764 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
607 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
1073 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 
545 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
607 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
545 aa  197  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
571 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
923 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
559 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  33.47 
 
 
600 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  40.07 
 
 
387 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
545 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
573 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
588 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>