More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1512 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1115    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  52.3 
 
 		 360 aa  359  9e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  39.67 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 481 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 578 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.32 
 
 		 620 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 740 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 636 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 3145 aa  230  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 662 aa  229  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.47 
 
 		 703 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 1005 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.73 
 
 		 1034 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 599 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.17 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.4 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1827 aa  224  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 648 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 767 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.87 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 602 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 615 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.46 
 
 		 1677 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.64 
 
 		 689 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.6 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 1450 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 620 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 714 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 681 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 688 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 607 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 747 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  34.95 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  34.95 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  34.95 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  35.19 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 592 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.86 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.86 
 
 		 626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 614 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.73 
 
 		 614 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.73 
 
 		 614 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 457 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 637 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 955 aa  197  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 780 aa  196  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.89 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.32 
 
 		 760 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.3 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1038 aa  193  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 646 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 653 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.19 
 
 		 653 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 612 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 935 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 639 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.11 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.38 
 
 		 872 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 546 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 583 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1212 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.89 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 559 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.69 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.67 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.86 
 
 		 1764 aa  181  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 438 aa  181  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 529 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.2 
 
 		 604 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.94 
 
 		 1077 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  33.49 
 
 		 705 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 747 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 635 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>