More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0892 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  76.01 
 
 
626 aa  915    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  66.4 
 
 
615 aa  785    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  90.21 
 
 
639 aa  1103    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  66.99 
 
 
620 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  76.63 
 
 
614 aa  912    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  90.88 
 
 
635 aa  1114    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  75.8 
 
 
626 aa  916    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  76.68 
 
 
614 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  91.68 
 
 
637 aa  1126    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
636 aa  1252    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  75.8 
 
 
626 aa  921    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  91.99 
 
 
611 aa  1085    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  67.64 
 
 
620 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  98.69 
 
 
612 aa  1186    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  90.88 
 
 
635 aa  1114    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  76.68 
 
 
614 aa  909    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  76.68 
 
 
614 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  76.85 
 
 
614 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
740 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 
601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.05 
 
 
689 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
681 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
747 aa  303  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
602 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 
648 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 
608 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
3145 aa  285  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.63 
 
 
574 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
1827 aa  280  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
637 aa  280  8e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
714 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.43 
 
 
577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 
592 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
955 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
935 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.79 
 
 
1034 aa  270  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
1450 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
688 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
523 aa  260  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.92 
 
 
714 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 
1005 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.07 
 
 
615 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
767 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.83 
 
 
703 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
747 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.73 
 
 
603 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
662 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
520 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.88 
 
 
1677 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.58 
 
 
653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
1454 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
1451 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
556 aa  233  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
780 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.91 
 
 
636 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 
1212 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
646 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
1038 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 
649 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 
649 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
583 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 
558 aa  217  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.58 
 
 
810 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.9 
 
 
733 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 
412 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
505 aa  210  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.19 
 
 
1077 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 
878 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
472 aa  208  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
438 aa  207  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
595 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.84 
 
 
540 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.82 
 
 
760 aa  204  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 
604 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
607 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34 
 
 
550 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29.76 
 
 
630 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
566 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
607 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.16 
 
 
1764 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
484 aa  193  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 
3035 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  41.86 
 
 
387 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.18 
 
 
473 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.48 
 
 
872 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 
527 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.43 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 
595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.85 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
545 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 
457 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  34.02 
 
 
600 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
923 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>