More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2618 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  100 
 
 		 630 aa  1287    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  50.59 
 
 		 607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.58 
 
 		 604 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 601 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 602 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 592 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.3 
 
 		 703 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 542 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 		 714 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 3145 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 714 aa  230  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1450 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 688 aa  217  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 689 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.77 
 
 		 473 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 608 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 955 aa  210  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 935 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.6 
 
 		 648 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 615 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.81 
 
 		 1034 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 472 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 740 aa  207  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 649 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.98 
 
 		 1764 aa  206  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 649 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 646 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 1005 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 620 aa  205  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  38.07 
 
 		 360 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 681 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 639 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.66 
 
 		 1077 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.22 
 
 		 760 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 457 aa  198  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 636 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 767 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  37.57 
 
 		 387 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.27 
 
 		 620 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 747 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1827 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 747 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1038 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 637 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 637 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 546 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.33 
 
 		 577 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.33 
 
 		 872 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.26 
 
 		 653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.45 
 
 		 603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 635 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 635 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 614 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 614 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 614 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 614 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 626 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.31 
 
 		 1677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.55 
 
 		 626 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 780 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 520 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  27.98 
 
 		 615 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 484 aa  174  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 636 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  34.82 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7048  hypothetical protein  30.19 
 
 		 579 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0796926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.76 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  28.99 
 
 		 600 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 545 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 573 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 545 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 588 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 558 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 1212 aa  160  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.01 
 
 		 540 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  33.23 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.1 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 412 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>