More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1661 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  97.61 
 
 		 502 aa  989    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 502 aa  1014    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 502 aa  1014    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 546 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  44.31 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  41.06 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.94 
 
 		 714 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 		 542 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  40.04 
 
 		 714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 		 646 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 649 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 649 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.93 
 
 		 1677 aa  246  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.66 
 
 		 1077 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 		 1005 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 1034 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 601 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 592 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 608 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 602 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 688 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 3145 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1450 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 653 aa  210  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.68 
 
 		 653 aa  210  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 574 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.99 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.31 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 523 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.2 
 
 		 689 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  35.65 
 
 		 577 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 740 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.75 
 
 		 703 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 681 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 527 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 662 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 545 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.68 
 
 		 648 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1212 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 607 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 747 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.5 
 
 		 1764 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.77 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.06 
 
 		 620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 1451 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 1454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 767 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.69 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 1038 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1827 aa  180  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 		 626 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 780 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 583 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 614 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.65 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 614 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 614 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 935 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.1 
 
 		 600 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 923 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.28 
 
 		 546 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 559 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 615 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 571 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 588 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 620 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.73 
 
 		 615 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.29 
 
 		 872 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 612 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  34.92 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 		 1073 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 529 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 636 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7048  hypothetical protein  36.05 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0796926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 760 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 955 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 536 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 747 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  32.1 
 
 		 630 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  34.66 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>