More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0257 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
457 aa  914    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40.27 
 
 
608 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.55 
 
 
703 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
1827 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 
1450 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  36.64 
 
 
648 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
578 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
767 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 
740 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
780 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 
747 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
1038 aa  239  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 
653 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.41 
 
 
653 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.24 
 
 
760 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
955 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
3145 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 
556 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  39.43 
 
 
387 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
542 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.08 
 
 
689 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
1005 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
601 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
523 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
688 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 
747 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 
646 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
527 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
558 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
649 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
649 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.14 
 
 
714 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.4 
 
 
1077 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
714 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.03 
 
 
1034 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
935 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
505 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
520 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
662 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
540 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 
602 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 
636 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
472 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.36 
 
 
872 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.7 
 
 
577 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  39.23 
 
 
385 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 
604 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
1212 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  37.54 
 
 
360 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
484 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
607 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.26 
 
 
545 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 
550 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
588 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
546 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  31.8 
 
 
630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.64 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
592 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
593 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  35.02 
 
 
389 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
637 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
545 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
545 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.15 
 
 
615 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
559 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.05 
 
 
615 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
620 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
502 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.48 
 
 
1764 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
611 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.16 
 
 
546 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
681 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.01 
 
 
620 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.87 
 
 
1677 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  34.27 
 
 
600 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
529 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 
496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 
545 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.41 
 
 
503 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 
595 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
612 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
573 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
636 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
566 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
595 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
607 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.57 
 
 
603 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 
705 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
1073 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
406 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
655 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>