More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1825 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 523 aa  1074    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  43.19 
 
 		 1827 aa  476  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 740 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  42.83 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  42.49 
 
 		 747 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  42.95 
 
 		 577 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  41.27 
 
 		 648 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 578 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  42.6 
 
 		 747 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  36.83 
 
 		 615 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.32 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.38 
 
 		 703 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.18 
 
 		 620 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 955 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  40.52 
 
 		 1038 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 		 620 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 3145 aa  299  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 520 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 615 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 1450 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.41 
 
 		 689 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 767 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 688 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 653 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.97 
 
 		 653 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.82 
 
 		 1034 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 626 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 601 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  38.86 
 
 		 438 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 935 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 662 aa  272  9e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1005 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 529 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.68 
 
 		 1677 aa  266  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 		 639 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 612 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.81 
 
 		 760 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 636 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 614 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.96 
 
 		 626 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 		 412 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 780 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 637 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.47 
 
 		 872 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 637 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.87 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.6 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 646 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 714 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 542 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.91 
 
 		 1077 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.12 
 
 		 714 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 681 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  34.39 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  41.18 
 
 		 387 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 607 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 1454 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 1451 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 1212 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 611 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.76 
 
 		 545 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.6 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  30.92 
 
 		 546 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 527 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 588 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 		 558 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 573 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.41 
 
 		 1764 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 		 540 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  31.7 
 
 		 600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 583 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  40.13 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  33.26 
 
 		 705 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.37 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>