244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4231 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
536 aa  1077    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  58.04 
 
 
588 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  57.93 
 
 
545 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  56.18 
 
 
546 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  62.11 
 
 
593 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  58.47 
 
 
571 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  57.72 
 
 
545 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  58.73 
 
 
573 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  58.73 
 
 
600 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  58.73 
 
 
496 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.09 
 
 
545 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  55.1 
 
 
545 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  53.01 
 
 
559 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 
611 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  42.08 
 
 
607 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  44.18 
 
 
711 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  44.29 
 
 
598 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  44.29 
 
 
598 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  41.89 
 
 
705 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
601 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
602 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.19 
 
 
703 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
1038 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
740 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
1827 aa  211  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
767 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
1450 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
487 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
688 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 
608 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 
473 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
3145 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.83 
 
 
577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
529 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  35.65 
 
 
602 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  36.71 
 
 
499 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  36.32 
 
 
492 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.75 
 
 
1077 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.11 
 
 
1677 aa  187  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
520 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
574 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.65 
 
 
653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  36.36 
 
 
488 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
780 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 
689 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.64 
 
 
1764 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
556 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
747 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.78 
 
 
620 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
620 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.79 
 
 
1034 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
412 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  37.54 
 
 
747 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
637 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
1005 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
472 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
595 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
615 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
583 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
607 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
649 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
649 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 
626 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
592 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
1212 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.23 
 
 
872 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  35.9 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 
615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 
648 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
646 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.18 
 
 
714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 
612 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 
438 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
614 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.92 
 
 
626 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
451 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  34.88 
 
 
387 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
502 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
614 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
681 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
457 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 
614 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
614 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 
614 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  34.66 
 
 
389 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.51 
 
 
626 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.87 
 
 
502 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
502 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
527 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
484 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
714 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.26 
 
 
603 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
639 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
935 aa  159  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.73 
 
 
604 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>