More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0339 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 545 aa  1106    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  83.58 
 
 		 546 aa  917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  61.41 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  58.46 
 
 		 545 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  58.65 
 
 		 545 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  61.82 
 
 		 571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  56.74 
 
 		 559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  59.6 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  60.16 
 
 		 496 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  54.91 
 
 		 588 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  59.6 
 
 		 573 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  60.2 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  56.09 
 
 		 536 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  46.33 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  45.15 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  43.69 
 
 		 705 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  45.26 
 
 		 711 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  45.26 
 
 		 598 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 578 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.75 
 
 		 703 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 740 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1827 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 688 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 767 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 747 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 1038 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 1450 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 608 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 542 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 556 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 648 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 602 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.76 
 
 		 689 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 3145 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.98 
 
 		 1764 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 487 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.6 
 
 		 472 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.17 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.13 
 
 		 1034 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1005 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 780 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  35.31 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  40.29 
 
 		 747 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.93 
 
 		 620 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.51 
 
 		 872 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  36.62 
 
 		 602 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 955 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  35.39 
 
 		 499 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 620 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.62 
 
 		 1677 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 529 aa  193  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.53 
 
 		 653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.92 
 
 		 1077 aa  190  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 527 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  34.7 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 649 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 935 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 649 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 714 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 646 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.19 
 
 		 760 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 		 714 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  34.35 
 
 		 602 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 1212 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.14 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 481 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.31 
 
 		 454 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.69 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.69 
 
 		 626 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 612 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 615 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 607 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.38 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 412 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 595 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 681 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 1454 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 639 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 1451 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 636 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 923 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>