282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0486 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 481 aa  992    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  38.4 
 
 		 525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  43.08 
 
 		 550 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  45.86 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 607 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 1034 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 955 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.63 
 
 		 1677 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 602 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  30.51 
 
 		 546 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 3145 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 1450 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1038 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1005 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 578 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.18 
 
 		 733 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 454 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.02 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.09 
 
 		 872 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.03 
 
 		 1764 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 662 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 574 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.9 
 
 		 703 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.95 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.4 
 
 		 648 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 740 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 608 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 		 577 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 760 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 637 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 559 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 935 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 523 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 542 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.24 
 
 		 615 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 747 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.13 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 612 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  29.79 
 
 		 705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 620 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 571 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 688 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 636 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 529 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1827 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1212 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 767 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 780 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 588 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 545 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.22 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  30.49 
 
 		 600 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  30.09 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 639 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.57 
 
 		 620 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  26.83 
 
 		 653 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 653 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.33 
 
 		 1077 aa  140  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 592 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 611 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 637 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 1073 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 389 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 593 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 573 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.61 
 
 		 540 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 		 598 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>