More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2412 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
529 aa  1058    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  43.15 
 
 
574 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  42.89 
 
 
578 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  42.49 
 
 
577 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  41.7 
 
 
703 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  39.79 
 
 
542 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  40.33 
 
 
648 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
1450 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
1827 aa  286  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.65 
 
 
689 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.37 
 
 
1034 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 
688 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
767 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 
523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.18 
 
 
760 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
1005 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 
740 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 
608 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
1038 aa  263  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
615 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
601 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
3145 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
438 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.68 
 
 
620 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
484 aa  250  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
620 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
747 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
747 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
454 aa  246  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
780 aa  246  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 
636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.53 
 
 
653 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
653 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 
612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
955 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.4 
 
 
626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 
637 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
472 aa  236  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
611 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
592 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
602 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 
614 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
635 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  33.94 
 
 
615 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 
614 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
614 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
635 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 
626 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
639 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
637 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  37.3 
 
 
540 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  38.48 
 
 
636 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.13 
 
 
473 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
614 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 
614 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 
527 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.37 
 
 
626 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
556 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
935 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 
714 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
681 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.15 
 
 
1077 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 
646 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 
1451 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.57 
 
 
503 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 
1454 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
520 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
649 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
649 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
662 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.46 
 
 
714 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  33.33 
 
 
630 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
588 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.51 
 
 
604 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
559 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
412 aa  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
593 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
571 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
607 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
573 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.57 
 
 
603 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
545 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
607 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.75 
 
 
1764 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.89 
 
 
1677 aa  203  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
1073 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
611 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
595 aa  200  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.14 
 
 
546 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  38.12 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 
545 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
545 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
558 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
546 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
583 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>