258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2921 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 389 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 		 955 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 935 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 1450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 747 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1212 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  39.68 
 
 		 1677 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 523 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 780 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.84 
 
 		 1077 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1038 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.36 
 
 		 1034 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 1005 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 592 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 688 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  38.29 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 		 457 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.98 
 
 		 760 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  38.9 
 
 		 529 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 740 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  41.24 
 
 		 703 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 558 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  38.48 
 
 		 615 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 662 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 637 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 1827 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 578 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  36.05 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 574 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 767 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 3145 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  36.77 
 
 		 648 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.98 
 
 		 653 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 653 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 681 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.77 
 
 		 603 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  40.29 
 
 		 637 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.22 
 
 		 689 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 1073 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.53 
 
 		 1764 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  35 
 
 		 525 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 608 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.75 
 
 		 872 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 		 615 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 620 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  33.94 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 		 612 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 601 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 602 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.82 
 
 		 639 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 527 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 611 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.77 
 
 		 620 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 583 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 542 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 611 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  36.23 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 635 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 635 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 595 aa  159  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 636 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.91 
 
 		 473 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 546 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 505 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.56 
 
 		 540 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  35.18 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.09 
 
 		 550 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 481 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.86 
 
 		 714 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 595 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.29 
 
 		 626 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 714 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.52 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 923 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 646 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 		 626 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 747 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 		 614 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 614 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.39 
 
 		 614 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 		 614 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 649 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 649 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 		 536 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2854  hypothetical protein  38.29 
 
 		 585 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 1451 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>