More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3354 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1212 aa  2450    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 1450 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 1827 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 3145 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 		 1038 aa  298  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 		 688 aa  284  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.43 
 
 		 760 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 		 620 aa  278  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  42.5 
 
 		 620 aa  277  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  39.75 
 
 		 615 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  40.94 
 
 		 872 aa  275  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  41.22 
 
 		 740 aa  271  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.04 
 
 		 1034 aa  268  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 1005 aa  264  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 412 aa  259  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 608 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 923 aa  252  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.1 
 
 		 578 aa  251  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 574 aa  250  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.63 
 
 		 703 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.17 
 
 		 1764 aa  244  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 472 aa  244  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.23 
 
 		 653 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  39.8 
 
 		 577 aa  243  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 653 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 636 aa  243  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.74 
 
 		 473 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 767 aa  236  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 935 aa  233  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 639 aa  232  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 747 aa  231  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 612 aa  231  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.31 
 
 		 689 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.33 
 
 		 626 aa  230  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 636 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 523 aa  229  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 556 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 780 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 592 aa  228  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 955 aa  228  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  39.4 
 
 		 601 aa  227  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 505 aa  225  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  38.56 
 
 		 637 aa  226  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 635 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 635 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  33.69 
 
 		 1077 aa  223  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.71 
 
 		 648 aa  222  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.24 
 
 		 1677 aa  222  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.49 
 
 		 614 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.49 
 
 		 626 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  38.38 
 
 		 387 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 		 611 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 637 aa  218  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 520 aa  218  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 614 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 614 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.56 
 
 		 614 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.56 
 
 		 614 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.56 
 
 		 626 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 602 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 542 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.17 
 
 		 389 aa  214  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 457 aa  213  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 546 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 545 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  36.07 
 
 		 503 aa  212  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 545 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 607 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.97 
 
 		 714 aa  207  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 1073 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  38.29 
 
 		 747 aa  206  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 714 aa  205  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 484 aa  205  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 681 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 583 aa  203  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  37.95 
 
 		 360 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 573 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 360 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  35.23 
 
 		 546 aa  197  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  32.26 
 
 		 600 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 496 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 662 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.01 
 
 		 603 aa  196  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 611 aa  196  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 571 aa  194  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 389 aa  193  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 593 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 502 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.25 
 
 		 550 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 558 aa  192  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 529 aa  192  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 527 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 588 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.81 
 
 		 545 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.42 
 
 		 454 aa  191  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  35.65 
 
 		 385 aa  190  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 502 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  33.65 
 
 		 502 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 1454 aa  188  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 1451 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>