More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3120 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 767 aa  1507    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  50.53 
 
 		 703 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 740 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  38.92 
 
 		 648 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.24 
 
 		 689 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.88 
 
 		 608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.07 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 3145 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 714 aa  326  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1827 aa  326  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 955 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.18 
 
 		 620 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 620 aa  320  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 747 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 615 aa  310  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 653 aa  299  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.62 
 
 		 653 aa  299  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 649 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 649 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.71 
 
 		 646 aa  298  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 1450 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 		 523 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 601 aa  292  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 		 574 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.52 
 
 		 577 aa  290  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 1038 aa  287  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.22 
 
 		 760 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 		 688 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.14 
 
 		 626 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.22 
 
 		 1077 aa  281  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 602 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 529 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 1005 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  33.73 
 
 		 615 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 780 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 542 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.84 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.84 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.17 
 
 		 1034 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 		 626 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 614 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 935 aa  266  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 639 aa  265  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 612 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 520 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.03 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 614 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 595 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.55 
 
 		 1677 aa  251  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 412 aa  250  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 681 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 457 aa  247  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.6 
 
 		 733 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 556 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 592 aa  244  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 472 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  41.02 
 
 		 387 aa  241  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.77 
 
 		 636 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.25 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 484 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.6 
 
 		 872 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 637 aa  237  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 878 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 607 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1212 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 		 550 aa  231  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.6 
 
 		 810 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 546 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.02 
 
 		 503 aa  228  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  36.81 
 
 		 540 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.17 
 
 		 546 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.86 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 595 aa  225  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 		 545 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 1454 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 1451 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 1073 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 559 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 705 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 923 aa  216  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.67 
 
 		 600 aa  214  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 496 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  38.51 
 
 		 360 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.72 
 
 		 389 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  28.97 
 
 		 630 aa  210  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 545 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.71 
 
 		 603 aa  207  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>