More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2985 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  100 
 
 
1077 aa  2215    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
3145 aa  286  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
714 aa  281  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.02 
 
 
689 aa  281  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.15 
 
 
714 aa  279  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
740 aa  279  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
601 aa  277  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 
542 aa  274  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  38.48 
 
 
473 aa  269  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
602 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
767 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 
1450 aa  262  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
935 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.25 
 
 
1034 aa  254  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
556 aa  253  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
592 aa  253  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
608 aa  252  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.27 
 
 
648 aa  251  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
747 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
472 aa  248  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.01 
 
 
653 aa  247  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
653 aa  247  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 
1005 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
649 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
649 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
955 aa  245  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.4 
 
 
577 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 
646 aa  244  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
574 aa  243  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
688 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
546 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  42.64 
 
 
747 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
527 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
620 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
615 aa  239  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.45 
 
 
703 aa  239  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
595 aa  238  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.12 
 
 
760 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
523 aa  237  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
1827 aa  235  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 
502 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.27 
 
 
1677 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.66 
 
 
502 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 
502 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
681 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.3 
 
 
620 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
780 aa  232  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 
578 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  36.34 
 
 
558 aa  229  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  38.59 
 
 
387 aa  228  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
520 aa  227  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
639 aa  224  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.25 
 
 
1764 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
637 aa  222  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.41 
 
 
872 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 
457 aa  219  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 
1451 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 
1454 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 
412 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
1038 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
662 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
604 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 
484 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.89 
 
 
540 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.44 
 
 
626 aa  214  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
612 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
1212 aa  214  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 
607 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
637 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.87 
 
 
454 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
614 aa  210  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
607 aa  208  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.97 
 
 
615 aa  208  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.82 
 
 
626 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
505 aa  207  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 
626 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
571 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
529 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 
614 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 
614 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
614 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  36 
 
 
360 aa  205  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
583 aa  204  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
595 aa  205  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.06 
 
 
600 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 
496 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
545 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
545 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 
573 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
614 aa  201  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.27 
 
 
546 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.98 
 
 
733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  27.66 
 
 
630 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.95 
 
 
603 aa  197  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
635 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
635 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
1073 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
636 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.2 
 
 
389 aa  194  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 
588 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>