More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3832 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  90.41 
 
 		 1450 aa  1253    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 688 aa  1378    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  43.09 
 
 		 1005 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.49 
 
 		 1034 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 3145 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 1038 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1827 aa  425  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.51 
 
 		 1677 aa  350  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 601 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 574 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.65 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.79 
 
 		 714 aa  316  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  39.05 
 
 		 577 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 		 615 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 		 714 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.77 
 
 		 556 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 578 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  43.12 
 
 		 473 aa  297  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 681 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.67 
 
 		 620 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.75 
 
 		 689 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 740 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.76 
 
 		 653 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 653 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 620 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.36 
 
 		 648 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 472 aa  287  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 523 aa  286  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.31 
 
 		 703 aa  286  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 935 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  38.9 
 
 		 646 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 		 767 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 649 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 592 aa  279  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 649 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 955 aa  277  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.27 
 
 		 603 aa  278  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.29 
 
 		 760 aa  273  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 614 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.72 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 542 aa  273  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 		 1212 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.4 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 614 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 747 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 780 aa  267  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 		 747 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 923 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 639 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 520 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.93 
 
 		 615 aa  257  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 636 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  41.58 
 
 		 387 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  40.73 
 
 		 412 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 611 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  39.16 
 
 		 872 aa  247  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  42.51 
 
 		 385 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 662 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 637 aa  244  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.07 
 
 		 1077 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 635 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 635 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  39.94 
 
 		 360 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  41.86 
 
 		 389 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.79 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.66 
 
 		 1764 aa  230  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 583 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.4 
 
 		 604 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 588 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.07 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 457 aa  224  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 545 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 546 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.4 
 
 		 546 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 545 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  30.65 
 
 		 630 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 593 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 496 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 595 aa  214  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 1451 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 1454 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  34.09 
 
 		 600 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>