More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3746 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
602 aa  1219    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  84.5 
 
 
601 aa  1042    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
592 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 
620 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 
1450 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 
688 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.88 
 
 
620 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 
615 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
3145 aa  344  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 
608 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  39.26 
 
 
626 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  38.94 
 
 
626 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 
614 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
614 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  38.46 
 
 
614 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  38.46 
 
 
614 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  38.46 
 
 
626 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 
556 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 
614 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.19 
 
 
689 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 
578 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 
639 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 
637 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
1827 aa  307  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 
1005 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
612 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
636 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  34.23 
 
 
630 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.41 
 
 
1034 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
681 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
1038 aa  297  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 
611 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 
740 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 
635 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 
714 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 
635 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
574 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 
472 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
607 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  39.87 
 
 
473 aa  287  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.95 
 
 
604 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
955 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
935 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
637 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.49 
 
 
615 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.14 
 
 
577 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.96 
 
 
653 aa  278  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
653 aa  278  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.32 
 
 
703 aa  277  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.35 
 
 
648 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
767 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
523 aa  272  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.63 
 
 
603 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 
542 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
714 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.82 
 
 
1077 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.13 
 
 
649 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.13 
 
 
649 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
646 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
747 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.91 
 
 
760 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
595 aa  259  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
520 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
780 aa  250  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
611 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.79 
 
 
1764 aa  246  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
1454 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
1451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
484 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  33.9 
 
 
540 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
747 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.45 
 
 
1677 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
607 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 
546 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
636 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
583 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.18 
 
 
872 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 
545 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
527 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.34 
 
 
454 aa  227  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
536 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  37.69 
 
 
545 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 
559 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
588 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
571 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
529 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
573 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
593 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 
550 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  39.84 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.41 
 
 
546 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
438 aa  220  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
496 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
545 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.32 
 
 
600 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.42 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
505 aa  217  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.7 
 
 
733 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
502 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>