More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0141 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 438 aa  900    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.83 
 
 		 577 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 		 574 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  38.86 
 
 		 523 aa  274  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  36.87 
 
 		 1827 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 529 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1038 aa  245  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.11 
 
 		 454 aa  239  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 740 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 601 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 3145 aa  233  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 955 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  34.27 
 
 		 615 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 688 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.57 
 
 		 540 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 1005 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1450 aa  230  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 935 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.17 
 
 		 1034 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.34 
 
 		 626 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  35.6 
 
 		 648 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 542 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 747 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 602 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 747 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 681 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 620 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.92 
 
 		 703 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 637 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.78 
 
 		 620 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 603 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 		 760 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 662 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 614 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.25 
 
 		 473 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 556 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 626 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.8 
 
 		 626 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 614 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.1 
 
 		 1764 aa  206  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 592 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 639 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.41 
 
 		 714 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 780 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 612 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 583 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 767 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 636 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.62 
 
 		 1677 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 637 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 559 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 588 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 545 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 714 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 		 646 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 649 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 649 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 		 600 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 593 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 573 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 571 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 545 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.62 
 
 		 689 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 		 705 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30 
 
 		 1077 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1212 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  31.46 
 
 		 546 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  29.88 
 
 		 872 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 579 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  33 
 
 		 598 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  33 
 
 		 711 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 598 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 636 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 653 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.42 
 
 		 653 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 360 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 		 512 aa  163  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>