More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3866 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  100 
 
 		 1677 aa  3374    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 3145 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1827 aa  465  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 1005 aa  443  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.39 
 
 		 1034 aa  439  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 1450 aa  440  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 688 aa  350  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 662 aa  280  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 583 aa  279  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.1 
 
 		 603 aa  279  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 472 aa  274  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 923 aa  273  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 637 aa  270  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 740 aa  269  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  38.07 
 
 		 935 aa  268  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 542 aa  267  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.97 
 
 		 473 aa  266  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 523 aa  266  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 681 aa  266  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 		 608 aa  262  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 556 aa  261  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.71 
 
 		 703 aa  261  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.54 
 
 		 714 aa  260  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 955 aa  255  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 636 aa  254  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.86 
 
 		 653 aa  254  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 653 aa  254  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 646 aa  253  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 578 aa  252  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.44 
 
 		 648 aa  248  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 767 aa  247  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  35.93 
 
 		 502 aa  246  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 		 502 aa  246  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 649 aa  245  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 649 aa  245  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 714 aa  244  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  33.73 
 
 		 577 aa  243  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 602 aa  242  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 502 aa  240  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 601 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 574 aa  238  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.57 
 
 		 620 aa  236  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  33.27 
 
 		 1077 aa  234  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 615 aa  232  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 607 aa  232  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.84 
 
 		 689 aa  231  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 612 aa  230  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 636 aa  230  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 620 aa  229  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.52 
 
 		 626 aa  227  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 760 aa  227  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 592 aa  225  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  34.66 
 
 		 503 aa  224  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 639 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 635 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 635 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 747 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.68 
 
 		 1764 aa  219  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 550 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1212 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.04 
 
 		 626 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 614 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 611 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 614 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 484 aa  216  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.69 
 
 		 626 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 546 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 		 780 aa  214  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.69 
 
 		 614 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 611 aa  214  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.69 
 
 		 614 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 505 aa  214  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 614 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 637 aa  213  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 595 aa  213  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.2 
 
 		 454 aa  213  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  36.5 
 
 		 872 aa  212  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 527 aa  211  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  31.32 
 
 		 525 aa  210  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  37.79 
 
 		 747 aa  209  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 571 aa  202  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 496 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  34.8 
 
 		 600 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 		 360 aa  199  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 573 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 655 aa  199  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 520 aa  198  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 593 aa  198  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1451 aa  198  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 529 aa  197  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1454 aa  197  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.03 
 
 		 546 aa  197  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 545 aa  197  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 588 aa  196  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 438 aa  195  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 545 aa  194  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 545 aa  193  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.62 
 
 		 545 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 1073 aa  193  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>