More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0308 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 636 aa  1224    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  41.43 
 
 		 935 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 955 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  41.56 
 
 		 662 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  44.37 
 
 		 740 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  40.72 
 
 		 648 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 577 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  39.95 
 
 		 1038 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  37.5 
 
 		 1677 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1827 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  37.63 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 520 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 1450 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 523 aa  246  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 637 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 681 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 601 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1005 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 688 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 767 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.53 
 
 		 1034 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 		 550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 602 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 3145 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 583 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.37 
 
 		 556 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.78 
 
 		 603 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 747 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 655 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  39.13 
 
 		 703 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 		 529 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  38.58 
 
 		 747 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 		 542 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 1212 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.93 
 
 		 620 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 612 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.97 
 
 		 639 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 457 aa  212  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.59 
 
 		 689 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 607 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.39 
 
 		 540 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 		 637 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.21 
 
 		 626 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.38 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  36.01 
 
 		 653 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 653 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.62 
 
 		 760 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 620 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.38 
 
 		 614 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.38 
 
 		 614 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 780 aa  204  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.38 
 
 		 614 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.52 
 
 		 872 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  38.01 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  38.01 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 614 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 527 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.98 
 
 		 615 aa  200  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.74 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 		 614 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.33 
 
 		 473 aa  197  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  43.3 
 
 		 387 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 406 aa  195  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.44 
 
 		 1764 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 646 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 649 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 649 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.08 
 
 		 1077 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 502 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.52 
 
 		 502 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 472 aa  190  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 604 aa  190  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 		 714 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 714 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 923 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  37.07 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  36.32 
 
 		 541 aa  181  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 607 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  37.77 
 
 		 705 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1454 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 611 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1451 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  30.37 
 
 		 630 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 566 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>