More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2058 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1451 aa  2937    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1454 aa  2943    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 3145 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 602 aa  245  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 592 aa  244  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 648 aa  241  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 601 aa  240  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 637 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  55.07 
 
 		 208 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 626 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 653 aa  230  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.09 
 
 		 653 aa  230  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 614 aa  230  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 		 626 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 614 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 612 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 		 614 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 614 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 		 614 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 542 aa  229  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 1450 aa  228  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 611 aa  227  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.58 
 
 		 620 aa  226  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.91 
 
 		 714 aa  226  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 635 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 635 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 639 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 608 aa  225  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 578 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 523 aa  224  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 636 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 714 aa  222  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 		 626 aa  221  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.59 
 
 		 1077 aa  219  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1827 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 615 aa  219  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 		 620 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  33.79 
 
 		 577 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 681 aa  214  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 637 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 688 aa  214  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 740 aa  213  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 767 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 574 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.74 
 
 		 760 aa  209  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.41 
 
 		 603 aa  209  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 556 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 1005 aa  206  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 529 aa  205  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 689 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.22 
 
 		 872 aa  201  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 747 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 607 aa  201  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 1038 aa  201  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 520 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 472 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.85 
 
 		 1034 aa  199  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 		 955 aa  199  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.91 
 
 		 1677 aa  199  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 604 aa  197  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 747 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 595 aa  197  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 649 aa  196  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 649 aa  196  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 611 aa  195  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 646 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.47 
 
 		 703 aa  194  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 607 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 412 aa  191  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.86 
 
 		 615 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 502 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 583 aa  184  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2193  hypothetical protein  33.26 
 
 		 552 aa  184  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 527 aa  184  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.56 
 
 		 502 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2057  hypothetical protein  33.26 
 
 		 541 aa  184  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 502 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 558 aa  183  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 780 aa  181  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 1212 aa  180  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 662 aa  179  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.92 
 
 		 1764 aa  178  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 		 473 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 546 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 505 aa  173  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 484 aa  172  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 636 aa  172  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  30.54 
 
 		 546 aa  172  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.17 
 
 		 512 aa  171  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 		 646 aa  169  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 545 aa  169  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  37.65 
 
 		 600 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 496 aa  167  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 1073 aa  166  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 530 aa  165  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 545 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 545 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 573 aa  164  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 438 aa  162  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>